酮康唑是一種殺真菌劑，並用於洗髮水治療由真菌感染導致的頭皮屑。包含這種成分的洗髮水經常用於治療嚴重真菌感染。酮康唑濃度2%的洗髮水能幫助控制中度頭皮屑。洗髮水必須按摩進頭皮，並保持至少5分子才能有效清除感染。在使用含酮康唑的洗髮水之前應諮詢醫生，因為這種成分有導致肝損傷的可能。研究表明酮康唑在雄激素性脱髮或男性型脱髮的長期治療中起重要作用。由於真菌的細胞膜對它們的生存至關重要，酮康唑通過干擾這些細胞膜來殺死真菌。它也可以用於其他情況，如牛皮癬，頭皮屑，男性模式脱髮和更多。

研究表明，它也可能有助於阻止DHT並促進頭髮生長。一項比較局部使用酮康唑溶液和各種濃度的米諾地爾的研究發現，將酮康唑與米諾地爾一起使用比單獨使用米諾地爾對頭髮生長的刺激更大。