儘管蜂蜜經常被用作多種疾病的自然療法，但有些人會對它產生過敏反應。研究表明，對植物花粉和蜂刺毒液過敏或敏感的人有髮生蜂蜜過敏的機會。對蜂蜜的過敏反應的嚴重程度和症狀會有所不同，具體取決於蜂蜜的種類和類型。當觸發免疫機制將無害的過敏原識別為有害的並做出反應以保護身體免受其傷害時，就會發生過敏反應。對蜂蜜的過敏反應可以通過食用甚至在某些情況下與皮膚接觸而引發。
瘙癢
皮膚通常與過敏反應有關，個體會在全身出現全身瘙癢，形成紅色的腫脹斑塊，這些斑塊在數小時後消失，不會留下疤痕或效果。馬里蘭大學醫學中心還列出了蕁麻疹，它是皮膚上凸起的紅腫，是對蜂蜜過敏反應的皮膚症狀。
嘔吐和腹瀉
過敏反應導致免疫系統由白細胞產生稱為IgE抗體的化學物質。抗體會迅速將攝入的蜂蜜檢測為體內有害物質，並引起免疫反應。克利夫蘭診所列出了胃腸道過敏症狀，例如腹痛，抽筋，腹脹，噁心，嘔吐和腹瀉。
打噴嚏
蜂蜜花粉引起的過敏症狀是流鼻涕，發癢，持續打噴嚏，喘息和呼吸困難。對蜂蜜和其他過敏原的這種輕度過敏反應是由一種稱為組胺的物質引起的，該物質由白細胞釋放，導致鼻子和肺部血管擴張和滲漏。這些過敏症狀可能會發展為更嚴重的過敏反應形式，包括某些人的過敏反應，並由於氣道狹窄而產生危及生命的症狀，如胸痛，胸口收緊和呼吸困難，需要立即緊急治療。
